يُشكل المكتب التنفيذي لاتحاد طلاب مصر من تسعة أعضاء من ضمنهم رئيس ونائب رئيس اتحاد طلاب مصر.
وينتخب أعضاء المكتب من أعضاء مجلس اتحاد طلاب مصر.
يُعين وزير التعليم العالي أو من يفوضه مديرا ماليا وسكرتارية تنفيذية لمجلس الاتحاد بناءً على اقتراح مجلس الاتحاد.
ويختص المكتب بمتابعة تنفيذ قرارات مجلس اتحاد طلاب مصر.